特殊な歯周病のひとつに、急性壊死性潰瘍性歯肉炎・歯周炎があります。急性壊死性潰瘍性歯肉炎は、通常の歯周病とは症状が違います。歯肉が炎症を起こしてかなり痛み、歯みがきも困難になります。口臭もひどくなり、重症になると、発熱、頭痛、倦怠感（けんたいかん）などの症状があらわれることもあります。この病気は主に18歳から30歳の成人期に見られ、歯肉が壊死して歯間乳頭部が陥没します。原因は口腔内を不潔にしていることですが、そこに過度なストレス、過労などの要因が加わって発症します。歯肉がひどく痛むため、ブラッシングやスケーリング、プロービングはできません。治療法としては、できるだけ歯肉に刺激を与えないよう、抗菌剤の投与とクロルヘキシジン溶液での洗口を第一に行います。痛み、症状が治まったあとは、通常の歯周基本治療に移行します。

根分岐部病変の治療は、もっとも難しい歯周治療のひとつといわれています。根分岐部病変とは、奥歯の根の分岐部（根分岐部）にまで組織破壊が進行した歯周病のことです。奥歯は噛み締めたときに耐えられるよう、1本の歯に2本あるいは3本の根を持っています。根分岐部は歯石の除去が難しく、患者さんにとっても歯みがきが難しい場所です。根分岐部病変を抱えた歯は症状があらわれにくく、また「歯周病を制することは、根分岐部病変を制すること」といわれるほどに、治療は大変困難です。そのため、 “根分岐部病変が進んだ歯は抜歯すべき”という意見を持つ専門医も少なくありません。